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东湖天蓝喇叭虫(Stentor coeruleus)种群的离散分化

利用筛选的12条10bp的随机引物对采自武汉市东湖(3个样点)、南湖(3个样点)、月湖(1个样点)和关桥(1个样点)四个水体的天蓝喇叭虫(Stentor coeruleus)种群进行了随机扩增多态DNA(RAPD)研究,所得清晰条带显示不同样点样本之间存在着一定的变异,其遗传距离在0.076—0.416之间.用Rapdistance1.04构建聚类图并探讨不同样点之间的遗传距离远近.结果显示南湖的3样点的遗传距离较近,在聚类图上聚成一枝,应该为同一个种群;而东湖的3个样点可能是由于地理隔离原因,在聚类图上


来源:湖泊科学      作者:刘志新,龚迎春,王爱芹,王启烁,余育和,冯伟松     发表于: 2007年3期     

日本血吸虫7个基因全长cDNA的获取和分析

目的从日本血吸虫成虫cDNA文库中分离、鉴定和分析全长cDNA序列,为日本血吸虫病的防治提供候选疫苗和药物靶点.方法从构建日本血吸虫成虫cDNA文库中挑取重组阳性克隆进行5'测序获取表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST),在此基础上进行引物延伸法(primer extension)测序,直至获取全长cDNA序列,将获取的基因登录GenBank,并进行生物信息学分析.结果获得7个日本血吸虫全长cDNA序列(GenBank登录号分别为AY336493~AY336499),


来源:中国人兽共患病杂志      作者:曾桥,肖建华,万志刚,张愉快,廖力,刘传爱,杨秋林     发表于: 2004年12期     

鸭跖草叶点霉的致病性与dsRNA及RAPD类群的相关分析

用随机引物扩增多态性(RAPD)和纤维素法对鸭跖草叶点霉Phyllosticta commelimecola的基因组遗传多样性和dsRNA进行测定,分析遗传多样性和dsRNA与菌株的致病力的关系. 结果表明菌株间存在明显的培养类型和致病力分化现象,菌株的致病力从南到北逐渐减弱. 选择东北地区有代表性的菌株,进行dsRNA测定和RAPD分析,在所测定的菌株中有10个含有dsRNA,2个不含dsRNA,菌株致病力强弱与dsRNA无相关性. 通过RAPD扩增和聚类分析,在类间距离15以下可将12个鸭跖草叶点霉分


来源:华南农业大学学报      作者:胡汉桥, 于莉, 李赤, 张锐     发表于: 2005年2期     

霍山石斛β-1,4-木糖基转移酶(IRX9)基因克隆及生物信息学分析

目的 克隆霍山石斛β-1,4-木糖基转移酶(IRX9)基因,并进行生物信息学、密码子偏性分析。方法 根据霍山石斛转录组数据获得的IRX9基因序列设计特异性引物,通过RT-PCR技术得到IRX9基因cDNA的全长序列,并进行生物信息学分析。结果 霍山石斛IRX9基因全长1 553 bp,包含一个长度为1 047 bp的开放阅读框,编码348个氨基酸,理论相对分子质量为39 350,等电点为7.26,为不含信号肽的亲水性稳定蛋白,定位于质膜,具有多个磷酸化位点和糖基化位点。系统进化树表明,该序列与同科植物铁皮


来源:中草药      作者:周佩娜,李阳,蒲天珍,余坤,张秀桥,龚玲     发表于: 2019年5期     

在长载体中引入定点突变的方法

背景与目的体外基因定点突变是分子生物学实验的常用方法。然而,虽然目前已经报道了多种基因突变的方法,但对于在长的载体序列中引入突变,一般的方法并不太容易实现。方法本研究在我们前期报告的基因突变方法的基础上,描述了一种简单易操作的可在长序列中引入定点突变的方法。这个方法的基本实验程序是:①确定待突变区域,合成一对均含有Type IIs类限制性内切酶位点载体引物,并合成一对互补的突变单链;②在突变区域之外的合适位置上,选择一个桥点,并合成一对均含有Type IIs类的限制性内切酶位点的桥点引物;③利用载体引物序


来源:中国肺癌杂志      作者:孟凡荣,陈琛,万海粟,周清华     发表于: 2014年7期     

利用RAPD-PCR探讨天蓝喇叭虫生物群系分化

选择天蓝喇叭虫(Stentor coeruleus)作为研究对象,对武汉市南湖、月湖、关桥3个水体共5个样点天蓝喇叭虫(S.coeruleus)样本的总DNA进行随机扩增多态DNA聚类分析,以检测各个样本的遗传相似性和趋异程度,借以评估样本间的遗传变异度。结果如下:(1)从98条随机引物中筛选12条引物共扩增出89条大小为100~1500bp的清晰条带,平均每条引物扩增出7.4条片段。(2)用Rapdistance1.04分析显示,不同样点样本之间存在着一定的变异,其遗传距离在0.076~0.416之间。


来源:生态学报      作者:刘志新,龚迎春,王爱芹,余育和,冯伟松     发表于: 2007年7期     

FANCJ在HEK293T细胞中的表达、纯化及活性检测

目的构建包含FANCJ野生型(wt)及其突变体N196S蛋白的真核表达载体,并对纯化的野生型蛋白及突变体蛋白进行活性检测。方法从HEK293T中提取RNA,并反转录为cDNA,使用带有3xFlag标签序列的特异性引物通过PCR方法扩增出人FANCJ编码区全长,并克隆到plvx-EF1-MCS-PGK-PURO载体上;突变体N196S利用NEBaseChanger TM引物设计工具,并利用NEB公司的点突变构建试剂盒Q5 Site-Directed Mutagenesis Kit技术进行操作。重组的FANC


来源:重庆医学      作者:袁濮玉,撖荣,杜佳慧,储小玲,吴洁,杨凡,苏倩,邱桥成,薛胜     发表于: 2018年36期     

生物质谱作为SNP分型检测方法的研究

利用改良的Miller法从人血中提取人类基因组DNA.采用聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR), 对含有单核苷酸多态性(SNP)点的DNA片段进行扩增,然后用CIP和Eox I去除掉PCR体系中剩余的脱氧核糖核苷三磷酸(dNTP)和引物,最后用单碱基延伸反应获得SNP位点处碱基类型.用基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)或电喷雾电离-四极杆飞行时间质谱(ESI-QqTOFMS)检测延伸产物与未延伸引物间的分子量差异,确定该点处碱基.对不同的生


来源:质谱学报      作者:杨何义,蔡耘,王杰,周钢桥,贺福初,钱小红     发表于: 2003年4期     
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